PROTHERM dispone de un conjunto variado de manípulos que ofrecen una gran versatilidad de uso en multitud de aplicaciones. El sistema reconoce automáticamente que tipos de manípulo electrodo tiene conectados y para su utilización basta sólo seleccionarlos a través del menú correspondiente.
PROTHERM puede trabajar en modos monopolar y bipolar según el manípulo que se use. Una placa de retorno es necesaria siempre que se utilice tecnología monopolar (también conocida como unipolar). Los manípulos de tipo lápiz tanto capacitivos como resistivos utilizan esta tecnología y por lo tanto requiren de dicha placa de retorno.
Los manípulos de tipo lápiz, tanto el modelo capacitivo como el resistivo, disponen de un conjunto de discos electrodo intercambiables.